Hi users,<br><br>Am running mdrun on gpu . I receive an error such as= <br><br>WARNING: This run will generate roughly 38570 Mb of data<br><br><br>WARNING: OpenMM does not support leap-frog, will use velocity-verlet integrator.<br>
<br><br>WARNING: OpenMM supports only Andersen thermostat with the md/md-vv/md-vv-avek integrators.<br><br><br>WARNING: OpenMM supports only Monte Carlo barostat for pressure coupling.<br><br><br>WARNING: OpenMM provides contraints as a combination of SHAKE, SETTLE and CCMA. Accuracy is based on the SHAKE tolerance set by the &quot;shake_tol&quot; option.<br>
<br>/bin/cat: file_loc: No such file or directory<br><br><br>and the job is running but the nothing written into .xtc, .trr, .edr files . What could have gone wrong?<br clear="all"><br>-- <br>Aiswarya  B Pawar<br><br>Bioinformatics Dept, <br>
Indian Institute of Science<br>Bangalore<br><br><br>