<html>

  <head>

    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"

      http-equiv="Content-Type">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    On 23/01/2012 5:13 PM, Anushree Tripathi wrote:

    <blockquote

cite="mid:CAAx43Bx=GmAwDfEAA0uoj4T=70e5qij+rD+gDsYiJ9GvJcCMcg@mail.gmail.com"

      type="cite">

      <pre><i>I am using gromacs 4.5.3 version and I am trying to follow the tutorials. For 

</i><i> starting I am following the *KALP15 in DPPC* 

</i><i> tutorial(<a moz-do-not-send="true" href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/gmx-tutorials/membrane_protein/02_topology.html" target="_blank">http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/gmx-tutorials/membrane_protein/02_topology.html</a>). 

</i><font face="Arial"><font size="3">I am not getting the point that is given below :

Next, create a <code>forcefield.doc</code> file that contains a description of the force field parameters in it.  Mine contains something like:

GROMOS 53A6 forcefield , extended to include Berger force field parameter.

Please guide me for creating forcefield.doc.

</font></font></pre>

      <br>

    </blockquote>

    <br>

    Have a look at the contents of this file in the pre-supplied force

    fields. Then look at the normal output of pdb2gmx. The former is

    used in the latter to help you pick the force field you want to use.<br>

    <br>

    Mark<br>

  </body>

</html>