<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jan 24, 2012 at 11:49 AM, lina <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:lina.lastname@gmail.com">lina.lastname@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div class="im">On Tue, Jan 24, 2012 at 11:42 AM, Spring buds &lt;<a href="mailto:winterhot82@gmail.com">winterhot82@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt; Hi lina,<br>
&gt;<br>
&gt; Thanks for reply. could you tell me how to remove completly the gromacs<br>
&gt; installation?<br>
<br>
</div>Which commands have you issued?<br></blockquote><div><br><pre><code>I used &quot;rm -rf /usr/local/gromacs&quot; but still I can see the gromacs files in /usr/local/bin</code>. How to remove here?<br> <br></pre></div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<br>
try make uninstall in the directory where you used make install<br>
before. like Path_to//gromacs-4.5.5<br>
and then make distclean<br>
for a totally clear re-installation, removed the /gromac-4.5.5 and<br></blockquote><div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
re-untar the gromacs-4.5.5.tar.gz<br>
<br>
before that, further check the lib and bin have totally removed or not.<br></blockquote><div><br>Sure. I will do now <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">

<br>
Which OS you are working on?<br></blockquote><div><br>Linux (CentOS 5.7) <br><br>Thanks a lot.<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">

<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; On Tue, Jan 24, 2012 at 2:31 AM, lina &lt;<a href="mailto:lina.lastname@gmail.com">lina.lastname@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; On 24 Jan, 2012, at 1:53, Spring buds &lt;<a href="mailto:winterhot82@gmail.com">winterhot82@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; &gt; Dear Gromacs users,<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt; Greetings!!!<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt; I am very new users and I am trying to install grmacs 4.5.5 or 3.3.3 for<br>
&gt;&gt; &gt; past four days. But still I am not able to. So I would like to ask some<br>
&gt;&gt; &gt; questions which are below.<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt; 1.My laptop is a dual core, which means two processors?.So should I need<br>
&gt;&gt; &gt; to install MPI?<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; --enable threads<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; &gt; 2.I installed gromacs 4.5.5 with mistakes. To remove installing, I used<br>
&gt;&gt; &gt; the &quot;which gromacs&quot; and it shows as &quot;/usr/bin/which: no mdrun in<br>
&gt;&gt; &gt; (/usr/kerberos/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/X11R6/bin:/home/Malai/bin)&quot;.<br>
&gt;&gt; &gt; However, I used &quot;rm -rf /usr/local/gromacs&quot; to remove installing I still can<br>
&gt;&gt; &gt; see tha gromacs files with red background in &quot;/usr/local/bin&quot;. Could you<br>
&gt;&gt; &gt; tell me I removed the gromacs installing?<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; You have not.<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt; 3.Could you please tell me the very simple steps for installatios, since<br>
&gt;&gt; &gt; I am a novice.<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; <a href="http://www.gromacs.org/Downloads/Installation_Instructions" target="_blank">http://www.gromacs.org/Downloads/Installation_Instructions</a><br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt; Many thanks in advance for your time and help.<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt; Huang Malai<br>
&gt;&gt; &gt; --<br>
&gt;&gt; &gt; gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
&gt;&gt; &gt; <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
&gt;&gt; &gt; Please search the archive at<br>
&gt;&gt; &gt; <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
&gt;&gt; &gt; Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
&gt;&gt; &gt; www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
&gt;&gt; &gt; Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
&gt;&gt; --<br>
&gt;&gt; gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
&gt;&gt; <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
&gt;&gt; Please search the archive at<br>
&gt;&gt; <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
&gt;&gt; Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
&gt;&gt; www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
&gt;&gt; Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; --<br>
&gt; gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
&gt; <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
&gt; Please search the archive at<br>
&gt; <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
&gt; Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
&gt; www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
&gt; Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>