<p>Oh, Justin&#39;s right. So I was wrong in my first mail, as well as in my mental picture... So fitting all to all is default... Terribly sorry :$</p>
<p>Tsjerk<br>
</p>
<p><blockquote type="cite">On Jan 24, 2012 12:05 PM, &quot;Justin A. Lemkul&quot; &lt;<a href="mailto:jalemkul@vt.edu">jalemkul@vt.edu</a>&gt; wrote:<br><br><p><font color="#500050">

Víctor wrote:
&gt;
&gt; I&#39;ve having some problems with use of the option &#39;-fitall&#39;.
&gt;
&gt; The command I&#39;m ...</font></p>
The -fitall option is set to &#39;yes&#39; by default, so invoking it explicitly makes no difference.<p><font color="#500050">

&gt; Furthermore, the rmsd.xpm file represents a non-symetric matrix, which is not what I expected......</font></p>
I can&#39;t explain this.  Perhaps someone else can offer insight.<br>
<br>
-Justin<p><font color="#500050">

&gt; Thanks in advance,
&gt; Víctor
&gt;
&gt; -- 
&gt;
&gt; Víctor Gil Sepúlveda
&gt; E. Informatica - FIB - UPC
&gt;

</font></p>
-- <br>
==============================<u></u>==========<br>
<br>
Justin A. Lemkul<br>
Ph.D. Candidate<br>
ICTAS Doctoral Scholar<br>
MILES-IGERT Trainee<br>
Department of Biochemistry<br>
Virginia Tech<br>
Blacksburg, VA<br>
jalemkul[at]<a href="http://vt.edu" target="_blank">vt.edu</a> | <a href="tel:%28540%29%20231-9080" value="+15402319080" target="_blank">(540) 231-9080</a><br>
<a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin" target="_blank">http://www.bevanlab.biochem.<u></u>vt.edu/Pages/Personal/justin</a><br>
<br>
==============================<u></u>==========<font color="#888888"><br>
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
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