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<body class='hmmessage'><div dir='ltr'>

hi all! <br>ı am doing tutorial 6 <a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/gmx-tutorials/free_energy/07_analysis.html" target="_blank">http://www.bevanlab.biochem.<wbr>vt.edu/Pages/Personal/justin/<wbr>gmx-tutorials/free_energy/07_<wbr>analysis.html</a> <br>

ı have a problem.. ı am collect all md.xvg files and run g_bar with below command..<br>g_bar -f md.xvg -o -oi -oh..<br><span lang="en"><span>the program</span> <span>gave</span> <span>me the following</span> <span>error..<br>

</span></span><span lang="en"><span>Why</span> <span>does not consist of</span> <span>bar.xvg</span> <span>file<br><br>please help me!&nbsp; thanks...<br>

</span></span>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; :-)&nbsp; g_bar&nbsp; (-:<br><br>Option&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Filename&nbsp; Type&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Description<br>------------------------------<div id=":h6"><wbr>------------------------------<br>&nbsp; -f&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; md.xvg&nbsp; Input, Opt!, Mult. xvgr/xmgr file<br>

&nbsp; -g&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ener.edr&nbsp; Input, Opt., Mult. Energy file<br>&nbsp; -o&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; bar.xvg&nbsp; Output, Opt! xvgr/xmgr file<br>&nbsp;-oi&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; barint.xvg&nbsp; Output, Opt! xvgr/xmgr file<br>&nbsp;-oh&nbsp; histogram.xvg&nbsp; Output, Opt! xvgr/xmgr file<br><br>Option&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Type&nbsp;&nbsp; Value&nbsp;&nbsp; Description<br>

------------------------------<wbr>------------------------<br>-[no]h&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; bool&nbsp;&nbsp; no&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Print help info and quit<br>-[no]version bool&nbsp;&nbsp; no&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Print version info and quit<br>-nice&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; int&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Set the nicelevel<br>

-[no]w&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; bool&nbsp;&nbsp; no&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; View output .xvg, .xpm, .eps and .pdb files<br>xvg&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; enum&nbsp;&nbsp; xmgrace&nbsp; xvg plot formatting: xmgrace, xmgr or none<br>-b&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; real&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Begin time for BAR<br>-e&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; real&nbsp;&nbsp; -1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; End time for BAR<br>

-temp&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; real&nbsp;&nbsp; -1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Temperature (K)<br>-prec&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; int&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The number of digits after the decimal point<br>-nbmin&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; int&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Minimum number of blocks for error estimation<br>-nbmax&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; int&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Maximum number of blocks for error estimation<br>

-nbin&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; int&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Number of bins for histogram output<br><br>md.xvg: 0.0 - 5000.0; lambda = 1.000<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; foreign lambdas: 0.000 (5250021 pts) 0.050 (5250021 pts)<br><br><br>Writing histogram to histogram.xvg<br>

<br>No results to calculate.<br></div>                                               </div></body>

</html>