Hello,<br><br>I am doing pulling simulations with GROMACS and would like to keep the chirality of the protein along the trajectory otherwise the protein will take the wrong chirality especially at long extensions. I have checked that using the improper dihedral or dihedral restraint can restrain the dihedral, but dihedral restraint is not equivalent to chirality restraint. So I am wondering if there is a &quot;chirality restraint&quot; somewhere in GROMACS. Otherwise I might have to modify the code...<br>
<br>Thanks in advance!<br><br clear="all"><br>-- <br>Li Sun<br>Department of Physics<br>University of California, San Diego<br>