<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div style="RIGHT: auto"><SPAN style="RIGHT: auto">Is &nbsp;DPPC a ligand or a compound ? <VAR id=yui-ie-cursor></VAR><BR style="RIGHT: auto" class=yui-cursor></SPAN></div>
<div style="RIGHT: auto"><BR style="RIGHT: auto"></div>
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 12pt">
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 12pt">
<DIV dir=ltr><FONT size=2 face=Arial>
<DIV style="BORDER-BOTTOM: #ccc 1px solid; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid; PADDING-BOTTOM: 0px; LINE-HEIGHT: 0; MARGIN: 5px 0px; PADDING-LEFT: 0px; PADDING-RIGHT: 0px; HEIGHT: 0px; FONT-SIZE: 0px; BORDER-TOP: #ccc 1px solid; BORDER-RIGHT: #ccc 1px solid; PADDING-TOP: 0px" class=hr contentEditable=false readonly="true"></DIV><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">From:</SPAN></B> Anushree Tripathi &lt;anushritripathi@gmail.com&gt;<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">To:</SPAN></B> Discussion list for GROMACS users &lt;gmx-users@gromacs.org&gt; <BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Sent:</SPAN></B> Tuesday, January 31, 2012 10:56 AM<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Subject:</SPAN></B> [gmx-users] problem with making index.ndx<BR></FONT></DIV><BR>
<DIV id=yiv2027012068>I am using gromacs 4.5.3 version.When I run the command (i.e., make_ndx -f em.gro -o index.ndx),It is not showing any option for DPPC group which I want to include.Please tell me how could I merge or create this option for proceeding to the next step of NVT simulation. <BR></DIV><BR>-- <BR>gmx-users mailing list&nbsp; &nbsp; <A href="mailto:gmx-users@gromacs.org" ymailto="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</A><BR><A href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target=_blank>http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</A><BR>Please search the archive at <A href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target=_blank>http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</A> before posting!<BR>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <BR>www interface or send it to <A href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org"
 ymailto="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</A>.<BR>Can't post? Read <A href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target=_blank>http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</A><BR><BR></DIV></DIV></div></body></html>