<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    On 28/01/2012 7:09 AM, Alex Marshall wrote:
    <blockquote
cite="mid:CA+7Y12agxWVJOfBijFymTnbPKnmShddhRG7L-YF1RKc7AV4W6Q@mail.gmail.com"
      type="cite"><font face="tahoma, sans-serif">Hi all,</font>
      <div><font face="tahoma, sans-serif">I was trying to extend my
          simulation but I used the wrong .tpr file when I called
          mdrun_mpi. I didn't catch it in time and my checkpoint files
          were overwritten. Now I've used GROMPP to extend the
          simulation (as directed in&nbsp;<a moz-do-not-send="true"
href="http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Extending_Simulations">http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Extending_Simulations</a>)</font><span
          style="font-family:tahoma,sans-serif">, but when I use
          mdrun_mpi -append with the extended .tpr file, new output
          files are generated anyway. Is there a way around this, or
          will I just have to use trjcat or something once the new run
          has finished?</span><br>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
    The .cpt files contain checksums of the files that were written with
    them, which are checked when attempting to append later. If they
    don't match, mdrun is conservative and writes new files. So you will
    have to cut and paste later.<br>
    <br>
    Mark<br>
    <br>
  </body>
</html>