<div>Hello Gromacs Users:</div>
<div> </div>
<div>Any one has the experience of topolbuild?</div>
<div> </div>
<div>I tried to build *top file with the software of topolbuild</div>
<div> </div>
<div> ./topolbuild -n lipid -dir /home/computer/Tom/topbuild/topolbuild1_3/topolbuild1_3/dat/gromacs -ff oplsaa</div>
<div> </div>
<div>I chose oplssaa. But from the generated *top file,<strong> these charges in *top file can</strong></div>
<div><strong>not match the partial charges in file (in gromacs package) of </strong></div>
<div>/opt/gromacs-4.5.4/share/gromacs/top/oplsaa.ff/ffnonbonded.itp</div>
<div> </div>
<div>How to understand these charges on *top file, which topolbuild generates?</div>
<div>Thanks for your instruction!</div>
<div> </div>
<div>Tom </div>