Yes but those tips are not for bash scripts... :(<br><br><br><br><div class="gmail_quote">2012/2/3 Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div class="im">On 4/02/2012 12:21 AM, francesca vitalini wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi!<br>
I have to use the gromacs command trjconv to obtain a .gro file from a .xtc and a .pdb file. I have to do it for several files in a bash for loop so I&#39;d rather prefer to find a way to make my script type in the trjconv interactive terminal always the same number for the system. Any tips?<br>

</blockquote>
<br></div>
Check out <a href="http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Using_Commands_in_Scripts" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Documentation/How-tos/Using_<u></u>Commands_in_Scripts</a><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>

<br>
Mark</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/<u></u>mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>