Dear Mark,<br><br><br>Believe me, I tried all methods that you said but unfortunately the result doesnt change :(<br><br><div class="gmail_quote">2012/2/4 Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000"><div class="im">
    On 4/02/2012 8:24 AM, ahmet yıldırım wrote:
    <blockquote type="cite">Dear users,<br>
      <br>
      I am using ubuntu 11.1 (64 bit). The Ubuntu normally runs when I
      dont run the Gromacs program. i.e there is not heating problem.
      But the CPU is excessive heating (82 degree) when I run the
      gromacs. <br>
    </blockquote>
    <br></div>
    There are various &quot;stress test&quot; programs you can get if you Google
    around. I expect these will produce the same symptoms.<div class="im"><br>
    <br>
    <blockquote type="cite">
      I am using the all cores at 100%. Now I have 2 PC.<span lang="en"><span>
          I use</span> <span>them separately</span></span>
      <br>
      1.first: It has Intel i7 920 CPU and Asus P6T SE motherboard<br>
      2.second: It has Intel I7 960 and Gıgabyte x58A-UD5 LGA 1366
      motherboard<br>
      I have the problem of warming/overheating on both computers. I <span lang="en"><span>could
          not figure out</span> <span>this problem</span> <span>for two weeks</span></span> :(<br>
      By the way:<br>
      -I dont use an older compiler to get the binary. I am using gcc
      4.6 and I am using Gromacs 4.5.4<br>
      -<span lang="en"><span>I watch</span> <span>the </span><span>temperature</span>s by &quot;<span>lm
          sensor</span>&quot; <span>program</span></span><br>
      -I installed ubuntu 32-bit but the result didnt change again<br>
      -I have sufficient cooling on both PC<br>
    </blockquote>
    <br></div>
    I&#39;d say this is evidence that you don&#39;t have sufficient cooling.<div class="im"><br>
    <br>
    <blockquote type="cite">It is likely something related to the program because
      <span lang="en"><span>no</span> <span>problem with</span> <span>any hardware</span> <span>related to
          computers</span></span> <span lang="en"><span>according to</span>
        <span>experts say</span></span>.<br>
    </blockquote>
    <br></div>
    If things are installed correctly. For example, cheap thermal paste
    between the CPU and heat sink can cause these symptoms.<div class="im"><br>
    <br>
    <blockquote type="cite">
      <br>
      what do you suggest? :(<br>
    </blockquote>
    <br></div>
    Get more cooling. Maybe lower the clock speed (if possible). Run a
    less efficient MD code!<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
    <br>
    Mark</font></span><div class="im"><br>
    <br>
    <blockquote type="cite"><br>
      <b>atk0110-acpi-0<br>
        Adapter: ACPI interface<br>
        Vcore Voltage:       +1.22 V  (min =  +0.80 V, max =  +1.60 V)<br>
         +3.3 Voltage:       +3.31 V  (min =  +2.97 V, max =  +3.63 V)<br>
         +5 Voltage:         +5.00 V  (min =  +4.50 V, max =  +5.50 V)<br>
         +12 Voltage:       +12.03 V  (min = +10.20 V, max = +13.80 V)<br>
        CPU FAN Speed:      2163 RPM  (min =  600 RPM)<br>
        CHASSIS1 FAN Speed:    0 RPM  (min =  600 RPM)<br>
        CHASSIS2 FAN Speed: 2033 RPM  (min =  600 RPM)<br>
        POWER FAN Speed:       0 RPM  (min =    0 RPM)<br>
        CPU Temperature:     +82.0°C  (high = +60.0°C, crit = +75.0°C)<br>
        MB Temperature:      +45.0°C  (high = +45.0°C, crit = +75.0°C)<br>
        <br>
        radeon-pci-0200<br>
        Adapter: PCI adapter<br>
        temp1:        +60.5°C </b><br>
      <br>
      <br>
      -- <br>
      Ahmet Yıldırım<br>
      <br>
      <br>
      <fieldset></fieldset>
      <br>
    </blockquote>
    <br>
  </div></div>

<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Ahmet Yıldırım<br><br>