Dear Gromacs Users!<br><br>I&#39;m investigating activation of the GPCRs receptor in the membrane<br>Because of potentialy long time required for the activation of such receptors I want to perform some sort of steered MD simulation. For example I I want to change rotameric dihedrals of some important swith residues during the productiv MD run to simulate destabilisation of some cruisial interactions wich stabilise innactive conformation of the receptor.<br>

<br>some example of such simulation without required detailes could be found here<br><a href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/bi0506019" target="_blank">http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/bi0506019</a><br><br><br>Could you provide me with the simlest example of methodology of such dihdral changes during simulation as well as application of some external forces on the specified objects?<br>
<br>James<br>