Justin,<br><br><div class="gmail_quote"><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Larger cutoffs would not only make the problem worse (read the error message carefully and consider the minimum image convention), but it would also potentially break the validity of the force field model.  The vdW cutoff for Gromos96 should be 1.4 nm, not 0.9 nm, in any case.</blockquote>

<div><br>This sounds controversially alitle :) <br><br>Today I&#39;ve tried such simulation with the 1.2 cutoffs and obtain the same error on the 3rd ns ( density was 1.35 )<br>From the error message I&#39;ve understood that the problem was due to the Z- box vector wich was decreased up to the 3 nm ( this is smaller rhan 2x 1.2 of R_list cutoff ). So in accordance to that message I understood that cutof must be &gt; 1.5 in the case of my system didnt it?<br>

<br>By the way  I never seen such large cutoff distance in the Gromos parameters. IS there any else way to solve my problem ?<br><br>James<br></div></div>