
<html>

  <head>

    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"

      http-equiv="Content-Type">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    On 17/02/2012 8:38 PM, Bipan Dutta wrote:

    <blockquote

      cite="mid:1329471519.77203.YahooMailNeo@web113611.mail.gq1.yahoo.com"

      type="cite">

      <div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times

        new roman, new york, times, serif;font-size:14pt">

        <div>I want to do Classical molecular Dynamics stimulation with

          1 isobutyl cyanide and 100 water molecule. I cant create input

          file. Please help me to create the input file. <br>

        </div>

      </div>

    </blockquote>

    <br>

    You should start by doing and understanding all the tutorial

    material you can find via Google and the GROMACS website - even if

    it doesn't look all that relevant. This will help you understand

    what is required to do these simulations. Then please ask a focussed

    question :-)<br>

    <br>

    Mark<br>

  </body>

</html>