Dear All<div><br></div><div>I am doing umbrella sampling for a protein complex. After analysis I am finding that prifle.xvg has not converged. Now I want to extend simulation. I have already pulled one chain to the length of the box. Can I further pull by extending the box size and add more windows to umbrella sampling. Please suggest.</div>
<div>How one should ascertain the initial box size so that g_wham gives a converged profile.xvg.</div><div>Please help.</div><div>Shahid nayeem</div>