Dear Gromacs users,<br>              <br>                                i am planning to use buckingham potential for non-bonded interactions. i am specifying the same thing in the [defaults] directive  of the forcefield.itp file as <br>
 <br>[ defaults ]<br>; nbfunc        comb-rule       gen-pairs       fudgeLJ fudgeQQ<br>        2                  1                 no                0.0     1.0<br>Here my doubt are <br>1)  Am i using correct  options for the combination-rule and fudgeQQ ? <br>
2)   what i understood from manual is usage of option &#39;yes&#39; for the gen-pairs is not allowed with the buckingham potential and fudgeLj is used only when gen-pairs is set to &#39;yes&#39;   is my understanding correct?<br>
<br><br>Thank you in advance.<br><br><br><br>Regards,<br>Ramesh.<br>