
<html>

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    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"

      http-equiv="Content-Type">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    On 26/02/2012 8:36 PM, zhongjin wrote:

    <blockquote

      cite="mid:1330248977.40704.YahooMailClassic@web15603.mail.cnb.yahoo.com"

      type="cite">

      <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">

        <tbody>

          <tr>

            <td style="font: inherit;" valign="top">

              <div>Hello to all users,</div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>&nbsp;&nbsp; I am not sure how to set pressure if pcoupltype&nbsp; =

                semiisotropic</div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>it should be :</div>

              <div>; Pressure coupling&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

                Pcoupl&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = Parrinello-Rahman<br>

                Pcoupltype&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = semiisotropic<br>

                nstpcouple&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -1<br>

                ; Time constant (ps), compressibility (1/bar) and

                reference P (bar)<br>

                tau-p&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = 1&nbsp; 1<br>

                compressibility&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; =0 &nbsp;4.5e-5<br>

                ref-p&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = 1.0&nbsp;&nbsp; 1.0</div>

              <div>; Scaling of reference coordinates, No, All or COM<br>

                refcoord_scaling&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = No<br>

                ; Random seed for Andersen thermostat<br>

                andersen_seed&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = 815131</div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>or </div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>; Pressure coupling&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

                Pcoupl&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = Parrinello-Rahman<br>

                Pcoupltype&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = semiisotropic<br>

                nstpcouple&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -1<br>

                ; Time constant (ps), compressibility (1/bar) and

                reference P (bar)<br>

                tau-p&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = 1<br>

                compressibility&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; =0 &nbsp;4.5e-5<br>

                ref-p&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = 1.0&nbsp;&nbsp; 1.0&nbsp; 1.0</div>

              <div>; Scaling of reference coordinates, No, All or COM<br>

                refcoord_scaling&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = No<br>

                ; Random seed for Andersen thermostat<br>

                andersen_seed&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = 815131</div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>&nbsp;</div>

              <div>How many values should be set for ref_p&nbsp; and tau-p&nbsp;?</div>

            </td>

          </tr>

        </tbody>

      </table>

    </blockquote>

    <br>

    See manual 7.3.15<br>

    <br>

    Mark<br>

    <br>

  </body>

</html>