<div>Dear Gmx Users,</div>
<div> </div>
<div>I am wondering your approach for such system:</div>
<div> </div>
<div>Ligand binding alpha helix which is a part of big helical bundle - in reality the conformation is rather stable. I want to use position restrained dynamics - surely for terminal residues and possibly for the residue in the middle? (the lenght is app 9 nm). I want to avoid folding.</div>

<div>What is your opinion?</div>
<div>I want to perform this simulation as a starting point for binding free energy simulations via Umbrella Sampling then. I will have experimental validation via ITC.</div>
<div> </div>
<div>Please, let me know your opinion.</div>
<div> </div>
<div>Steven</div>