<div>Dear Gmx Users,</div>
<div> </div>
<div>I am running my protein with ligand. at the begining of my simulation the protein is far away from the ligand. Then in about 5-10 ns my ligand binds to the protein surface remaining there for rest 90-95 ns. Would you adjust coupling groups in thermostat as:</div>

<div>a) Protein_LIg and Water_and_ions</div>
<div>b) Protein Water_ions_LIG</div>
<div>c) Protein LIG Water_ions</div>
<div> </div>
<div>thank you</div>
<div> </div>
<div>Steven</div>