<div dir="ltr"><div>SC5 does not work?<br></div><div>Dariush</div><div> <br>--</div><div dir="ltr"><div>Kind Regards,<br>Dariush Mohammadyani<br>Department of Structural  Biology<br>University of Pittsburgh School of Medicine<br>
Biomedical Science  Tower 3<br>3501 Fifth Avenue<br>Pittsburgh, PA 15261<br>USA</div></div><div><br></div><div><br> </div><div class="gmail_quote">On Thu, Mar 8, 2012 at 2:34 PM, dina dusti <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:dinadusti@yahoo.com">dinadusti@yahoo.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;padding-left:1ex;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-width:1px;border-left-style:solid" class="gmail_quote"><div><div style="font-family:times new roman,new york,times,serif;font-size:12pt">
<div>Dear Gromacs Specialists,</div><div><br></div><div>May I ask you to help me for definition of pyrrole, tiofen and aniline in MARTINI coarse-grained force field, Please?</div><div>I defined them as following:</div><div>
aniline (one benzene ring+NH2) = SC4, SC4, SNd</div><div>pyrrole (one aromatic ring consists of 4 carbon and one NH) = SC4, SP1</div><div>tiofen (one aromatic ring consists of 4 carbon and one S) = ???</div><div>May I ask you to tell me your idea about these molecules, Please?</div>
<div><br></div><div>Thank you in advance.</div><div>Best Regards</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div>Dina<br></div><div><br></div><div></div></font></span></div></div><br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br></div>