Hello,<br><br>I would like to do cluster analysis in gromacs on my system which 
consists of a polymer and solvent . I would like to know how the solvent
 molecule surrounds around polymer and how many. <br>Can anybody help me
 out that how to start with or use g_cluster or g_clustsize in gromacs.<br>
Also there are different methods available like linkage, jarvis-patrick,
 monte-carlo, diagonalization or gromos so which would be better to use.<br clear="all"><br clear="all"><br>Thanx<br><font color="#888888"><font face="georgia,serif"><div style="color:rgb(0,0,153)"><b>Minal More</b>, <br>
</div><span style="color:rgb(0,0,153)"></span><br></font></font><br><br><br>