You cannot overcome it, unless you rewrite the code. IIRC, the TPI(C) code only accepts molecules for insertion in the same charge group, as it is stated in the error.<div><br></div><div>Best,</div><div>Joćo<br><br><div class="gmail_quote">

On Fri, Mar 9, 2012 at 11:05 PM, Tina Wang <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ttwang@princeton.edu">ttwang@princeton.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

I&#39;m encountering a problem in implementing particle insertion of carbon dioxide in a nanoparticle system. I&#39;m using tabulated potentials, in which I constructed two separate tables (one for nanoparticle-carbon potentials and one for nanoparticle-oxygen potentials). The groomp command required the carbon and oxygen to be in two different charge groups. However, the submission of the test produced an error that read: &quot;atoms in the molecule to be inserted cannot belong to multiple charge groups. Put them in the same charge group.&quot; I don&#39;t know how to overcome this contradiction. Any ideas?<div>



<br></div><div>Thanks!</div>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Joćo M. Damas<br>

PhD Student<br>Protein Modelling Group<br>ITQB-UNL, Oeiras, Portugal<br>Tel:+351-214469613<br>
</div>