<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div>&nbsp;&nbsp; Dear All,</div><div>&nbsp;</div><div>For Gromacs installation, my configure command is:</div><div>&nbsp;</div><pre>./configure --enable-shared LDFLAGS='-L/usr/local/lib' <span style="font-family: courier new,courier,monospace;">--disable-threads.</span></pre><pre><span style="font-family: courier new,courier,monospace;">After make, the error message is as following. </span></pre><pre><span style="font-family: courier new,courier,monospace;">I am looking forward to getting a reply from you on how to avoid the error message.</span></pre><pre><span style="font-family: courier new,courier,monospace;">Wholly</span></pre><pre><span style="font-family: courier new,courier,monospace;"></span>&nbsp;</pre><pre><span style="font-family: courier new,courier,monospace;"></span>&nbsp;</pre><pre><span style="font-family:
 courier new,courier,monospace;">.....<var id="yui-ie-cursor"></var></span></pre><pre><span style="font-family: courier new,courier,monospace;"><font size="1"><div><font size="4">.libs/gmx_fft_fftw3.o:gmx_fft_fftw3.c:(.text+0x2bb5): undefined reference to `_fftwf_destroy_plan'</font></div><font size="4">
</font><div><font size="4">.libs/gmx_fft_fftw3.o:gmx_fft_fftw3.c:(.text+0x2bcb): undefined reference to `_fftwf_destroy_plan'</font></div><font size="4">
</font><div><font size="4">.libs/gmx_fft_fftw3.o:gmx_fft_fftw3.c:(.text+0x2be1): undefined reference to `_fftwf_destroy_plan'</font></div><font size="4">
</font><div><font size="4">.libs/gmx_fft_fftw3.o:gmx_fft_fftw3.c:(.text+0x2bf7): more undefined references to `_fftwf_destroy_plan' follow</font></div><font size="4">
</font><div><font size="4">.libs/gmx_fft_fftw3.o:gmx_fft_fftw3.c:(.text+0x2c37): undefined reference to `_fftwf_free'</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">.libs/gmx_fft_fftw3.o:gmx_fft_fftw3.c:(.text+0x2d17): undefined reference to `_fftwf_free'</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">collect2: ld returned 1 exit status</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">Makefile:387: recipe for target `libmd.la' failed</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">make[3]: *** [libmd.la] Error 1</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">make[3]: Leaving directory `/cygdrive/d/GROMACSNEW/GROMACS455/gromacs-4.5.5/src/mdlib'</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">Makefile:302: recipe for target `all-recursive' failed</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">make[2]: *** [all-recursive] Error 1</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">make[2]: Leaving directory `/cygdrive/d/GROMACSNEW/GROMACS455/gromacs-4.5.5/src'</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">Makefile:238: recipe for target `all' failed</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">make[1]: *** [all] Error 2</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">make[1]: Leaving directory `/cygdrive/d/GROMACSNEW/GROMACS455/gromacs-4.5.5/src'</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">Makefile:347: recipe for target `all-recursive' failed</font></div><font size="3">
</font><div><font size="3">make: *** [all-recursive] Error 1</font></div></font></span></pre><pre><span style="font-family: courier new,courier,monospace;"></span>&nbsp;</pre><pre><span style="font-family: courier new,courier,monospace;"></span>&nbsp;</pre><pre><span style="font-family: courier new,courier,monospace;"></span>&nbsp;</pre><div>&nbsp;</div></div></body></html>