Hi everybody<br><br>After using genconf to build a .gro file for example containing 100000 molecules, I want to use grompp to minimize the system as the following:<br>  genconf -f H.gro -nbox 10 100 100 -o H-largebox.gro<br>
grompp -f minim.mdp -c H-largebox.gro -p topol.top -o HMin.tpr -maxwarn 1<br><br>Although I see in the H-largebox.gro file 100000 molecules coordination, <br>I receive the following error after running grompp.<br><br>-------------------------------------------------------<br>
Program grompp, VERSION 4.5.4<br>Source code file: grompp.c, line: 1370<br><br>Fatal error:<br>There was 1 error in input file(s)<br>For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS<br>website at <a href="http://www.gromacs.org/Documentation/Errors">http://www.gromacs.org/Documentation/Errors</a><br>
-------------------------------------------------------<br><br>&quot;Just a Minute While I Reinvent Myself&quot; (Red Hot Chili Peppers)<br><br>Would you please help me?<br><br>Thanks alot,<br><br>Best Regards,<br><br>Saly<br>