Hi Users:<br><br>I was trying to calculate the energy contribution of an specific ion in my simulation. After extract a given frame from the simulation, I recalculate the energies of this frame with mdrun -rerun. Then I used tpbconv and editconf to create a new gro file and a new tpr without the ion. I tried to run mdrun -rerun with this new files but the mdrun stops with the following error:<br>
<br>Program mdrun, VERSION 4.5.5<br>Source code file: domdec_top.c, line: 744<br><br>Software inconsistency error:<br>Not enough position restraint coordinates<br><br>What could be the problem?<br>Any possible solution?<br>