<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Dear Gromacs user,<br>
    <br>
    since a few days we try to get the heterogeneous parallelization on
    a Dell blade server with Tesla M2090 GPUs to work using the
    worksheet on the page:<br>
    <br>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/Documentation/Acceleration_and_parallelization">http://www.gromacs.org/Documentation/Acceleration_and_parallelization</a><br>
    <br>
    we only get the OpenMM pure GPU version with mdrun-gpu running.
    Actually is the heterogeneous parallelization already working in the
    development version you can download using the link on the page:<br>
    <br>
    &nbsp;<a class="moz-txt-link-freetext"
      href="http://www.gromacs.org/Developer_Zone/Roadmap/GROMACS_4.6">http://www.gromacs.org/Developer_Zone/Roadmap/GROMACS_4.6</a><br>
    <br>
    and how can we get it running? Just adding the CMake variable&nbsp;<span
      style="font-family: courier new,courier,monospace;">GMX_GPU=ON
      when compiling mdrun did not </span>enable the&nbsp; heterogeneous
    parallelization.<br>
    <br>
    We want to use the heterogeneous parallelization used in the 4.6
    version to find out which is the optimal GPU/CPU ratio for our
    studied systems, since we soon have to buy machines for the upgrade
    of our cluster.<br>
    <br>
    Thanks a lot<br>
    <br>
    yours<br>
    <br>
    Sebastian<br>
    <br>
    <br>
    <pre wrap="">
</pre>
    <h4 id="section_13" class="editable"><font color="#000000"><span
          class="Apple-style-span" style="color: rgb(79, 129, 189);
          font-size: 22px; font-weight: bold; line-height: 22px;"><br>
        </span></font></h4>
  </body>
</html>