Hello Everyone£¬<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I&lsquo;m confused about Normal Mode Analysis of Gromacs. I have googled a lot but find little useful.<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I installed Gromacs 4.5.5 by CMake on Win7(Double Precision).<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Gromacs manual said &quot;It is imperative that you use the <code>-t</code> option to <code><a title="Documentation/Gromacs_Utilities/grompp" rel="internal" href="http://www.gromacs.org/Documentation/Gromacs_Utilities/grompp">grompp</a></code> when you create the <span class="highlight" style="background-color:yellow">normal</span> mode <a title="Documentation/File_Formats/Topology_(.tpr)_File" rel="internal" href="http://www.gromacs.org/Documentation/File_Formats/Topology_%28.tpr%29_File">run input file</a>, so that you read full precision binary coordinates and not the three-decimal <a title="Documentation/File_Formats/.gro_File" rel="internal" href="http://www.gromacs.org/Documentation/File_Formats/.gro_File">.gro</a> file.&quot; But I don&#39;t exactly what it means....<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Could anyone give me a step-by-step example?<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; <br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; Thanks in advance.<br><br>shen <br>