hello sir,<br><br>Thanks for your kind reply...<br><br>my extended simulation for additional 10ns is completed and when i analysed its rmsd its showing random variation.. i am trying to form micelle.. maybe this is the reason for this random variation...<br>
<br> suppose if i extend my simulation further, maybe is it possible to get flat rmsd???<br><br>what maybe the cause for this random variation in rmsd..its varying between 2.1 to 2.5nm..<br><br>please help me with your answer..<br>
<br>Thanking you.<br><br><br>