<p>Hi Acoot,</p>
<p>What do you mean with &#39;not at all&#39;? What is the output of pdb2gmx? Did you check what is in those pdb files?</p>
<p>Cheers,</p>
<p>Tsjerk</p>
<p><blockquote type="cite">On Mar 22, 2012 5:06 AM, &quot;Acoot Brett&quot; &lt;<a href="mailto:acootbrett@yahoo.com">acootbrett@yahoo.com</a>&gt; wrote:<br><br><div><div style="font-size:12pt;font-family:times new roman,new york,times,serif">
<div>Dear All,</div><div> </div><div>I find some pdb files downloaded from RCSB cannot be recognized by pdb2gmx at all.</div><div> </div><div>Is any server which can convert and RCSB pdb files to files readable by pdb2gmx?</div>
<div> </div><div>Cheers,</div><div> </div><div>Acoot</div></div></div><br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></p>