I understand,<div>I am planning to run REMD between 300 and 600 K, so I think it is better equlibrating in NVT ensemble because at high temperature </div><div>water evaporates, is it?</div><div><br></div><div>Francesco<br>
<br><div class="gmail_quote">Il giorno 23 marzo 2012 10:53, Kukol, Andreas <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:a.kukol@herts.ac.uk">a.kukol@herts.ac.uk</a>&gt;</span> ha scritto:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi Francesco,<br>
<br>
It should be the same ensemble, in which you want to carry out the production REMD.<br>
<br>
Andreas<br>
<br>
&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;<br>
From: <a href="mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org">gmx-users-bounces@gromacs.org</a> [mailto:<a href="mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org">gmx-users-bounces@gromacs.org</a>] On Behalf Of francesco oteri<br>
Sent: 23 March 2012 09:41<br>
To: Discussion list for GROMACS users<br>
Subject: [gmx-users] REMD equilibration<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
Dear gromacs users,<br>
I have to perform REMD simulation, but since it is the first time I apply this tecnique I have a question regarding system equilibration.<br>
As far as I know, befaore starting the REMD each replica has to be equlibrated. The equilibration has to be carried out in the NPT ensemble <br>
or only in the NVT?<br>
<br>
<br>
Thanks in advance, Francesco<br>
</div></div><div class="HOEnZb"><div class="h5">--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Cordiali saluti, Dr.Oteri Francesco<br>
</div>