<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>
</head>
<body ocsi="0" fpstyle="1">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">
<p class="MsoNormal">Dear gromacs users,</p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal">Aside from a scale factor, should the time dependence of the temperature T(t) extracted from the .trr file with g_traj for a given residue be identical to the time dependence of the total kinetic energy (translational &#43; rotational) K(t)
 extracted from the .trr file with g_traj for the same residue? If not, why not? Based on the formal relationship between the kinetic energy and temperature (T ~ v^2) we expect them to be identical but our simulations do not yield this result. Any information
 would be much appreciated.</p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal">Roy</p>
<div><br>
<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;"><br>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>