Please start a new thread for a new topic.<br><br>T.<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Mar 29, 2012 at 12:39 AM, Asaf Farhi <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:asaf.farhi@weizmann.ac.il">asaf.farhi@weizmann.ac.il</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">




<div style="word-wrap:break-word">
<div style="direction:ltr;font-size:10pt;font-family:Tahoma">Dear GMCS users
<div><br>
</div>
<div>Hi. Does anyone know if MD at 20000K is feasible?</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks,</div>
<div>Best regards,</div>
<div>Asaf</div>
<div>
<div style="font-size:16px;font-family:Times New Roman">
<hr>
<div style="direction:ltr"><font face="Tahoma" color="#000000"><b>From:</b> <a href="mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-bounces@gromacs.org</a> [<a href="mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-bounces@gromacs.org</a>] on behalf of Erik Marklund [<a href="mailto:erikm@xray.bmc.uu.se" target="_blank">erikm@xray.bmc.uu.se</a>]<br>

<b>Sent:</b> Wednesday, March 28, 2012 10:37 PM<br>
<b>To:</b> Discussion list for GROMACS users<br>
<b>Subject:</b> Re: [gmx-users] x,y and z components of rmsf?<br>
</font><br>
</div><div><div class="h5">
<div></div>
<div>I believe that rmsf can compute anisotropic b-factors, but have not tried it myself.
<div><br>
</div>
<div>Erik<br>
<div><br>
</div>
<div><br>
<div>
<div>28 mar 2012 kl. 22.32 skrev patrick wintrode:</div>
<br>
<blockquote type="cite">
<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
<tbody>
<tr>
<td style="font:inherit" valign="top">Does some one know of a way to get g_rms or g_rmsf to write out the x, y, and z components of the rms(f) for each atom/residue separately?<br>
<br>
Thanks.<br>
<br>
Patrick L. Wintrode<br>
Department of Pharmaceutical Sciences<br>
University of Maryland<br>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a></blockquote>
</div>
<br>
<div><span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px">
<div style="word-wrap:break-word"><span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px">
<div style="word-wrap:break-word">
<div>-----------------------------------------------</div>
<div>Erik Marklund, PhD</div>
<div>Dept. of Cell and Molecular Biology, Uppsala University.</div>
<div>Husargatan 3, Box 596,    75124 Uppsala, Sweden</div>
<div>phone:    <a href="tel:%2B46%2018%20471%206688" value="+46184716688" target="_blank">+46 18 471 6688</a>        fax: <a href="tel:%2B46%2018%20511%20755" value="+4618511755" target="_blank">+46 18 511 755</a></div>
<div><a href="mailto:erikm@xray.bmc.uu.se" target="_blank">erikm@xray.bmc.uu.se</a></div>
<div><a href="http://www2.icm.uu.se/molbio/elflab/index.html" target="_blank">http://www2.icm.uu.se/molbio/elflab/index.html</a></div>
</div>
</span></div>
</span></span></div>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div></div></div>
</div>
</div>
</div>

<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Tsjerk A. Wassenaar, Ph.D.<br>
<br>post-doctoral researcher<br>Molecular Dynamics Group<br>* Groningen Institute for Biomolecular Research and Biotechnology<br>* Zernike Institute for Advanced Materials<br>University of Groningen<br>The Netherlands<br>