<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    On 5/04/2012 2:07 PM, Acoot Brett wrote:
    <blockquote
      cite="mid:1333598863.55355.YahooMailNeo@web121804.mail.ne1.yahoo.com"
      type="cite">
      <div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times
        new roman, new york, times, serif;font-size:12pt">
        <div><br>
          Dear All,</div>
        <div>&nbsp;</div>
        <div>In <a moz-do-not-send="true"
            href="http://www-personal.umich.edu/%7Eamadi/fwspidr_tutor.pdf">http://www-personal.umich.edu/~amadi/fwspidr_tutor.pdf</a>,
          there is a command</div>
        <div>&nbsp;</div>
        <div><font face="TimesNewRoman"><strong>tpbconv -f </strong>traj.trr
          </font><b><font face="TimesNewRoman,Bold">-s </font></b><font
            face="TimesNewRoman">topol.tpr </font><b><font
              face="TimesNewRoman,Bold">-e </font></b><font
            face="TimesNewRoman">ener.edr </font><b><font
              face="TimesNewRoman,Bold">-o </font></b><font
            face="TimesNewRoman">tpxout.tpr </font><b><font
              face="TimesNewRoman,Bold">&#8211;until </font></b><font
            face="TimesNewRoman">$VALUE</font></div>
        <div>&nbsp;</div>
        <div>But we know we never have the topol.tpr as I know.</div>
        <div>&nbsp;</div>
        <div>Will you please give a clarification?</div>
        <div>&nbsp;<br>
        </div>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
    Have you followed the commands up to that point? If so, you will
    likely have observed grompp write such a file, which is the default
    filename for grompp -o, as you can see with grompp -h.<br>
    <br>
    Mark<br>
  </body>
</html>