Thank you for the reply. I do not have such files in my directory or in my force field.<br><br>
<div class="gmail_quote">On Tue, Apr 10, 2012 at 10:59 AM, Carsten Kutzner <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ckutzne@gwdg.de">ckutzne@gwdg.de</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote style="BORDER-LEFT:#ccc 1px solid;MARGIN:0px 0px 0px 0.8ex;PADDING-LEFT:1ex" class="gmail_quote">Hi Steven,<br><br>you might have to remove files with weird names (such as ._name) in the directory where you run<br>
grompp or in your forcefield directory.<br><br>Carsten<br>
<div class="HOEnZb">
<div class="h5"><br><br>On Apr 10, 2012, at 11:52 AM, Steven Neumann wrote:<br><br>&gt; Dear Gmx Users,<br>&gt;<br>&gt; It is 1st time I came across such problem. While preparing my NPT simulation before umbrella samping:<br>
&gt;<br>&gt; grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf0.gro -p topol.top -n index.ndx -o npt0.tpr<br>&gt;<br>&gt; An input file contains a line longer than 4095 characters, while the buffer passed to fgets2 has size 4095. The line starts with: &#39;20s&#39;<br>
&gt;<br>&gt; Its not about the files in bad format as I have never had this problem  - I am using Gromacs 4.5.4 installed on the cluster, I am using PuTTy shell. I always use dos2gmx ibefore processing.<br>&gt;<br>&gt; Can you advise?<br>
&gt;<br>&gt; Steven<br>&gt;<br></div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">&gt; --<br>&gt; gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>&gt; <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
&gt; Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>&gt; Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
&gt; www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>&gt; Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
<br>--<br>gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</font></span></blockquote></div><br>