Dear Mark<br><br>I have already checked both sections but I don&#39;t understand.. That&#39;s why I am asking for help :-)<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 11, 2012 at 12:18 PM, Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mark.abraham@anu.edu.au">mark.abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div><span>On 11/04/12, <b>Chrisostomos Batistakis </b>&lt;<a href="mailto:tomyvanbatis@gmail.com" target="_blank">tomyvanbatis@gmail.com</a>&gt; wrote:</span></div>
<blockquote style="BORDER-LEFT:#00f 1px solid;PADDING-LEFT:13px;MARGIN-LEFT:0px" type="cite">
<div>Dear all<br><br>I am looking in the manual but I don&#39;t understand...<br><br>When using <b>vdw-type =cut-off</b> in the .mdp file, is the LJ potential only truncated in the cut-off distance r<font size="1">c</font>,  or is it also shifted in order to avoid discontinuity when <font size="-0">r<font size="1">ij</font>=r<font size="1">c</font></font> ?<br>
<br>If no, how can I have a shifted and truncated LJ potential?</div></blockquote>
<div> </div></div></div><div>Please check out the manual. Sections 4.1 and 7.3.11 come to mind.</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div> </div><div>Mark </div>
</font></span><br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br>