
<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:arial, helvetica, sans-serif;font-size:12pt"><div>Dear Gromacs friends,</div><div><br></div><div>I attached my .pdb file in this message, as you see, I have formyl residue in it. I'd like to get a .gro output of it by using this commands, but getting the fatal error:</div><div><br></div><div># pdb2gmx -f glc.pdb -o glc.gro -ignh -ter -water spc <br></div><div><br></div><div>Fatal error:<br>Residue 'FOR' not found in residue topology database</div><div><br></div><div>How can I solve this problem? <br></div><div><br></div><div>Thanks ,</div><div>Shima<br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></div></body></html>