<div class="gmail_quote"><br>Dear All,
<div>              I have tried installing gromacs (after installing fftw3 library)on a GPU system using the following :</div><div><br></div><div>./configure --with-fft=fftw3 --enable-float</div><div><br></div><div>After I type &quot;make&quot; I get the following error after sometime.</div>


<div>.</div><div>.</div><div>.</div><div><br></div><div><div>/usr/bin/ld: /home/anupam/fftw-3.3.1/.libs/libfftw3f.a(apiplan.o): relocation R_X86_64_32 against `a local symbol&#39; can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC</div>


<div>/home/anupam/fftw-3.3.1/.libs/libfftw3f.a: could not read symbols: Bad value</div><div>collect2: ld returned 1 exit status</div><div>make[3]: *** [<a href="http://libmd.la" target="_blank">libmd.la</a>] Error 1</div>

<div>make[3]: Leaving directory `/home/anupam/gromacs-4.5.5/src/mdlib&#39;</div>
<div>make[2]: *** [all-recursive] Error 1</div><div>make[2]: Leaving directory `/home/anupam/gromacs-4.5.5/src&#39;</div><div>make[1]: *** [all] Error 2</div><div>make[1]: Leaving directory `/home/anupam/gromacs-4.5.5/src&#39;</div>


<div>make: *** [all-recursive] Error 1</div></div><div><br></div><div><br></div><div>Please help me out in this regard.</div><div><br></div><div>Thanks </div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div><div>

Anupam</div>
</font></span></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Graduate Student,<br>Laboratory of Computational Biology,<br>Center For DNA Fingerprinting And Diagnostics,<br>4-1-714 to 725/2, Tuljaguda complex<br>Mozamzahi Road, Nampally,<br>

Hyderabad-500001<br>