<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Hi.<br><br>For each alpha carbon in my protein, I want to write out the x, y and z coordinates as separate time series.<br><br>If I use g_traj with the flags -oxt -x (or y orz) and -n along with an index file selecting the appropriate alpha carbon, will that do the trick? Does anyone know of a less cumbersome way of doing this?<br><br>Thanks.<br><br>Patrick L. Wintrode<br>University of Maryland School of Pharmacy<br></td></tr></table>