Friends,<br>I have created the top (attached) file for a tripeptide using pdb2gmx tool of gromacs. However in the top file, i dnt see the pdb2gmx writing the ff parameters. <br><br>I guess that the ff parameters are read directly from the ff.itp given in the given as  #include &quot;amber03.ff/forcefield.itp&quot;. Is there any way/tool with which i can write these parameters in a separate file. <br>
<br>Thanks,<br>Bala<br clear="all"><br>-- <br>C. Balasubramanian<br><br>