<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:arial, helvetica, sans-serif;font-size:12pt"><div><span style="font-style: italic;">I made it as the format of .top and .itp files, but still get the same error.</span></div><div><span style="font-style: italic;"></span><br></div>  <div style="font-family: arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;"> <div style="font-family: times new roman, new york, times, serif; font-size: 12pt;"> <div dir="ltr"> <font size="2" face="Arial"> <hr size="1">  <b><span style="font-weight:bold;">From:</span></b> Shima Arasteh &lt;shima_arasteh2001@yahoo.com&gt;<br> <b><span style="font-weight: bold;">To:</span></b> Discussion list for GROMACS users &lt;gmx-users@gromacs.org&gt; <br> <b><span style="font-weight: bold;">Sent:</span></b> Monday, April 23, 2012 3:05 PM<br> <b><span style="font-weight: bold;">Subject:</span></b> [gmx-users] .top file for POPC membrane<br> </font> </div> <br>
<div id="yiv1198836417"><div><div style="color:#000;background-color:#fff;font-family:arial, helvetica, sans-serif;font-size:12pt;"><div>Dear all gmx users,<br><br></div><div>I performed the pdb2gmx to get the .top file, but I faced this error: " Residue 'POP' not found in residue topology database ". So I decided to make a top file.<br></div><div>How can I make the .top file for popc.itp?</div><div>Anybody can guide me please?</div><div><br></div><div>Thanks in advance,</div><div>Shima<br> </div></div></div></div><br>-- <br>gmx-users mailing list&nbsp; &nbsp; <a ymailto="mailto:gmx-users@gromacs.org" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search"
 target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>www interface or send it to <a ymailto="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br><br> </div> </div>  </div></body></html>