<div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Apr 23, 2012 at 6:45 PM, Justin A. Lemkul <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jalemkul@vt.edu" target="_blank">jalemkul@vt.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
<br>
On 4/23/12 1:38 PM, Steven Neumann wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Dear Gromacs Users,<br>
<br>
My job failed on the cluster and I would like to run in from the checkpoint time<br>
created:<br>
<br>
mdrun -s umbrella0.tpr -cpi umbrella0.cpt -deffnm umbrella0 -pf<br>
pullf-umbrella0.xvg -px pullx-umbrella0.xvg<br>
<br>
Will existing files pullf-umbrella0.xvg  and pullx-umbrella0.xvg be updated as<br>
the command for the initial run is:<br>
<br>
mdrun -s umbrella0.tpr -deffnm umbrella0 -pf pullf-umbrella0.xvg -px<br>
pullx-umbrella0.xvg<br>
<br>
</blockquote>
<br></div></div>
I see no reason why they wouldn&#39;t be.  Is there some problem when executing the appending run?<br>
<br>
-Justin<br></blockquote><div><br><br>I am using 4.5.4. and -append is default. I am curious because I submit a script and only 3 out 6 files are copied back to my working directory, everything else is lost as only in temporary directly jobs can be run. No clue what is happening.<br>
<br>Steven <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<br>
-- <br>
==============================<u></u>==========<br>
<br>
Justin A. Lemkul<br>
Ph.D. Candidate<br>
ICTAS Doctoral Scholar<br>
MILES-IGERT Trainee<br>
Department of Biochemistry<br>
Virginia Tech<br>
Blacksburg, VA<br>
jalemkul[at]<a href="http://vt.edu" target="_blank">vt.edu</a> | <a href="tel:%28540%29%20231-9080" value="+15402319080" target="_blank">(540) 231-9080</a><br>
<a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin" target="_blank">http://www.bevanlab.biochem.<u></u>vt.edu/Pages/Personal/justin</a><br>
<br>
==============================<u></u>==========<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/<u></u>mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists</a><br>
</font></span></blockquote></div><br></div>