<div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Apr 27, 2012 at 3:17 PM, seera suryanarayana <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:palusoori@gmail.com" target="_blank">palusoori@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Respected Sir,<br><br>                    While i am running gromacs software i am getting the following error.Kindly knowing me how to over come the error.<br>
<br>                    Fatal error:<br>                                    number of coordinates in coordinate file (1cys_ion.gro, 99670)<br>
                                    does not match topology (1cys.top, 99680)<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br></font></span></blockquote><div>Your .top file contains 10 extra atoms than you .gro file. Check whether any ion has been mentioned twice by mistake in the .top file. </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br>SURYANARAYANA SEERA,<br>PhD student.<br>
</font></span><br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br></div>