Hi Gromacs Friends,<br> I am doing the justin-lipid tutorial..Link to the tutorial is ...<br><a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/gmx-tutorials/index.html">http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/gmx-tutorials/index.html</a><br>
<br>I made the g96_53a6_lipid force field as per the instruction of tutorial..<br><br>I have some queris regarding to these new force field<br><br>1.  As we added the lipid parameter to the force field and so <br>    I thought to use these force field to dppc to make topology <br>
    instead of downloading the topol_dppc.top given by justin.<br><br>   So my command line was     <br>  pdb2gmx -f dppc128.gro -p kkk.top -o kkk.gro -i kkk.itp -ignh <br><br><br>I got the reply<br><br>Fatal error:<br>Something is wrong in the coordinate formatting of file dppc128.gro. Note that gro is fixed format (see the manual)<br>
For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS<br>website at <a href="http://www.gromacs.org/Documentation/Errors">http://www.gromacs.org/Documentation/Errors</a><br>-------------------------------------------------------<br>
<br><br><br>I check the gro format .It is  right as per my knowledge  ..<br><br>What is the reason for such error???<br><br><br>And can I used that force field to generate the dppc topology instaed of downloading it from tutorial link..<br>
(As we made the changes in force field to adjust with lipid ....)<br><br>Rama david <br> <br>