<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>
</head>
<body ocsi="0" fpstyle="1">
<div style="direction: ltr;font-family: Calibri;color: #000000;font-size: 12pt;">
Dear Gmx Users,<br>
<br>
Many of you probably faced an error:<br>
<br>
&quot;An input file contains a line longer than 4095 characters, while the buffer passed to fgets2 has size 4095. The line starts with: '20s' &quot;<br>
<br>
As I noted this error comes from the changes in the topology. Gromacs somehow add &quot; _ &quot; and thus this problem occurs. For instance:<br>
<br>
<br>
<p class="MsoNormal" style="tab-stops:36.75pt 73.5pt 110.25pt 147.0pt 183.75pt 220.5pt 257.25pt 294.0pt 330.75pt 367.5pt 404.25pt 441.0pt 477.75pt 514.5pt 551.25pt 588.0pt 624.75pt 661.5pt 698.25pt 735.0pt 771.75pt 808.5pt 845.25pt 882.0pt 918.75pt 955.5pt 35.0cm 1029.0pt 1065.75pt 1102.5pt 1139.25pt 1176.0pt;
mso-layout-grid-align:none;text-autospace:none">
<span style="font-size:9.0pt;
font-family:&quot;Courier New&quot;;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:EN-US">[ bonds ]</span></p>
<p class="MsoNormal" style="tab-stops:36.75pt 73.5pt 110.25pt 147.0pt 183.75pt 220.5pt 257.25pt 294.0pt 330.75pt 367.5pt 404.25pt 441.0pt 477.75pt 514.5pt 551.25pt 588.0pt 624.75pt 661.5pt 698.25pt 735.0pt 771.75pt 808.5pt 845.25pt 882.0pt 918.75pt 955.5pt 35.0cm 1029.0pt 1065.75pt 1102.5pt 1139.25pt 1176.0pt;
mso-layout-grid-align:none;text-autospace:none">
<span style="font-size:9.0pt;
font-family:&quot;Courier New&quot;;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:EN-US">;<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;
</span>ai<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>aj funct<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>c0<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>c1<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>c2<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>c3</span></p>
<p class="MsoNormal" style="tab-stops:36.75pt 73.5pt 110.25pt 147.0pt 183.75pt 220.5pt 257.25pt 294.0pt 330.75pt 367.5pt 404.25pt 441.0pt 477.75pt 514.5pt 551.25pt 588.0pt 624.75pt 661.5pt 698.25pt 735.0pt 771.75pt 808.5pt 845.25pt 882.0pt 918.75pt 955.5pt 35.0cm 1029.0pt 1065.75pt 1102.5pt 1139.25pt 1176.0pt;
mso-layout-grid-align:none;text-autospace:none">
<span style="font-size:9.0pt;
font-family:&quot;Courier New&quot;;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:EN-US"><span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>2<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1 </span></p>
<p class="MsoNormal" style="tab-stops:36.75pt 73.5pt 110.25pt 147.0pt 183.75pt 220.5pt 257.25pt 294.0pt 330.75pt 367.5pt 404.25pt 441.0pt 477.75pt 514.5pt 551.25pt 588.0pt 624.75pt 661.5pt 698.25pt 735.0pt 771.75pt 808.5pt 845.25pt 882.0pt 918.75pt 955.5pt 35.0cm 1029.0pt 1065.75pt 1102.5pt 1139.25pt 1176.0pt;
mso-layout-grid-align:none;text-autospace:none">
<span style="font-size:9.0pt;
font-family:&quot;Courier New&quot;;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:EN-US"><span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>3<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1 </span></p>
<p class="MsoNormal" style="tab-stops:36.75pt 73.5pt 110.25pt 147.0pt 183.75pt 220.5pt 257.25pt 294.0pt 330.75pt 367.5pt 404.25pt 441.0pt 477.75pt 514.5pt 551.25pt 588.0pt 624.75pt 661.5pt 698.25pt 735.0pt 771.75pt 808.5pt 845.25pt 882.0pt 918.75pt 955.5pt 35.0cm 1029.0pt 1065.75pt 1102.5pt 1139.25pt 1176.0pt;
mso-layout-grid-align:none;text-autospace:none">
<span style="font-size:9.0pt;
font-family:&quot;Courier New&quot;;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:EN-US"><span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>4<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1 </span></p>
<p class="MsoNormal" style="tab-stops:36.75pt 73.5pt 110.25pt 147.0pt 183.75pt 220.5pt 257.25pt 294.0pt 330.75pt 367.5pt 404.25pt 441.0pt 477.75pt 514.5pt 551.25pt 588.0pt 624.75pt 661.5pt 698.25pt 735.0pt 771.75pt 808.5pt 845.25pt 882.0pt 918.75pt 955.5pt 35.0cm 1029.0pt 1065.75pt 1102.5pt 1139.25pt 1176.0pt;
mso-layout-grid-align:none;text-autospace:none">
<span style="font-size:9.0pt;
font-family:&quot;Courier New&quot;;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:EN-US"><span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>4<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>5<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1 </span></p>
<p class="MsoNormal" style="tab-stops:36.75pt 73.5pt 110.25pt 147.0pt 183.75pt 220.5pt 257.25pt 294.0pt 330.75pt 367.5pt 404.25pt 441.0pt 477.75pt 514.5pt 551.25pt 588.0pt 624.75pt 661.5pt 698.25pt 735.0pt 771.75pt 808.5pt 845.25pt 882.0pt 918.75pt 955.5pt 35.0cm 1029.0pt 1065.75pt 1102.5pt 1139.25pt 1176.0pt;
mso-layout-grid-align:none;text-autospace:none">
<span style="font-size:9.0pt;
font-family:&quot;Courier New&quot;;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:EN-US"><span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>4<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>6<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1 _</span></p>
<p class="MsoNormal" style="tab-stops:36.75pt 73.5pt 110.25pt 147.0pt 183.75pt 220.5pt 257.25pt 294.0pt 330.75pt 367.5pt 404.25pt 441.0pt 477.75pt 514.5pt 551.25pt 588.0pt 624.75pt 661.5pt 698.25pt 735.0pt 771.75pt 808.5pt 845.25pt 882.0pt 918.75pt 955.5pt 35.0cm 1029.0pt 1065.75pt 1102.5pt 1139.25pt 1176.0pt;
mso-layout-grid-align:none;text-autospace:none">
<span style="font-size:9.0pt;
font-family:&quot;Courier New&quot;;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:EN-US"><span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>4<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>24<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1 </span></p>
<p class="MsoNormal" style="tab-stops:36.75pt 73.5pt 110.25pt 147.0pt 183.75pt 220.5pt 257.25pt 294.0pt 330.75pt 367.5pt 404.25pt 441.0pt 477.75pt 514.5pt 551.25pt 588.0pt 624.75pt 661.5pt 698.25pt 735.0pt 771.75pt 808.5pt 845.25pt 882.0pt 918.75pt 955.5pt 35.0cm 1029.0pt 1065.75pt 1102.5pt 1139.25pt 1176.0pt;
mso-layout-grid-align:none;text-autospace:none">
<span style="font-size:9.0pt;
font-family:&quot;Courier New&quot;;mso-ansi-language:EN-US;mso-fareast-language:EN-US"><span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>6<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </span>7<span style="mso-spacerun:yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</span>1 </span></p>
<br>
I could not see &quot; _ &quot; using vi in my topology. However, when I copied all topology to another text editor I could. Then removing it solves the problem. Is that a bug?
<br>
This is just to inform people for the future as I have spent many hours to find out what is wrong.
<div><br>
Best,<br>
<br>
Jan<br>
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<div><font face="Arial" size="2"></font><br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>