Dear Gmx Users,<br><br>I would like to run energy minimization with some atoms restrained - this is a surface made of atoms which do not share any bonds. So the EM of water only. I tries to use define = -DPOSRES<br>in my EM file but then the surface atoms change their positions. Thus, when I want to run NVT equilibration I got errors of water molecules which cannot be settled so EM is needed. Would you advise something?<br>
<br>Steven<br>