Dear gromacs users, <div>I am trying to port a set of charm parameter in gromacs. </div><div><br></div><div>I am using the script <a href="http://convert_charmm_to_gromacs.pl">convert_charmm_to_gromacs.pl</a> contained in the file charmm_to_gromacs.tgz (<a href="http://www.gromacs.org/@api/deki/files/76/=charmm_to_gromacs.tgz">http://www.gromacs.org/@api/deki/files/76/=charmm_to_gromacs.tgz</a>).</div>
<div><br></div><div>Regarding dihedrals, the entry regarding the file says that pdb2gmx cannot</div><div><br></div><div><span style="color:rgb(79,107,114);font-family:arial,verdana,helvetica;font-size:12px;line-height:17px;background-color:rgb(255,255,255)">&quot;generate multiple periodic dihedral functions such as CHARMM uses for some dihedrals - </span></div>
<div><span style="color:rgb(79,107,114);font-family:arial,verdana,helvetica;font-size:12px;line-height:17px;background-color:rgb(255,255,255)">these must be converted to Ryckaert-Bellemans functions, i.e. expressed as a cosine power expansion&quot;</span></div>
<div><br></div><div><div>This assumption is no longer valid, is it?</div><div>As far as I know, infact, now gromacs support multiple periodic function (funtion 9), is it?</div><div><br></div><div><br></div> Francesco<br>
</div>