<html><head><base href="x-msg://35/"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><br><div><div>16 maj 2012 kl. 23.39 skrev Christopher Neale:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div ocsi="0" fpstyle="1"><div style="direction: ltr; font-family: Tahoma; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 10pt; "><span style="font-family: monospace; ">Thank you Stephane.<br><br>Unfortunately, neither of those links contains the information that I am seeking. Those links contain some example plots of autocorrelation functions including a discussion of time-spans over which the example time-series is autocorrelated and when it is not, but neither link defines the (exponential or integral) autocorrelation time except to show a plot and indicate when it is non-zero and when it fluctuates about zero.<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><br><br>For example, I already know that the autocorrelation time describes the exponential decay of the correlation and that two values drawn from the same simulation are statistically independent if they are separated by a sufficient number of (accurate) autocorrelation times, but this information is not exactly a definition of the autocorrelation time.<br><br>I am hoping to find a definition of the autocorrelation time in terms of the probability of drawing uncorrelated samples, although any complete definition will do.<br></span></div></div></span></blockquote><div><br></div><div>Aren't you looking for an interpretation rather than a definition? And will this not depend on the nature of the data?</div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>Erik</div><br><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div ocsi="0" fpstyle="1"><div style="direction: ltr; font-family: Tahoma; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 10pt; "><span style="font-family: monospace; "><br>If anybody else has the time, I would appreciate it.<br><br>Thank you,<br>Chris.<br><br>-- original message --<br><br></span>Probably these links give you simple and clear response for your question<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><a href="http://idlastro.gsfc.nasa.gov/idl_html_help/Time-Series_Analysis.html">http://idlastro.gsfc.nasa.gov/idl_html_help/Time-Series_Analysis.html</a><span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span>and<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><a href="http://www.statsoft.com/textbook/time-series-analysis/">http://www.statsoft.com/textbook/time-series-analysis/</a><span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span>HTH Stephane</div>--<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><br>gmx-users mailing list &nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a><span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span>before posting!<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><br>www interface or send it to<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can't post? Read<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a></div></span></blockquote></div><br><div>
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>-----------------------------------------------</div><div>Erik Marklund, PhD</div><div>Dept. of Cell and Molecular Biology, Uppsala University.</div><div>Husargatan 3, Box 596, &nbsp; &nbsp;75124 Uppsala, Sweden</div><div>phone: &nbsp; &nbsp;+46 18 471 6688 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;fax: +46 18 511 755</div><div><a href="mailto:erikm@xray.bmc.uu.se">erikm@xray.bmc.uu.se</a></div><div><a href="http://www2.icm.uu.se/molbio/elflab/index.html">http://www2.icm.uu.se/molbio/elflab/index.html</a></div></div></span></div></span></span>
</div>
<br></body></html>