<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, May 17, 2012 at 11:47 AM, priya thiyagarajan <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:priya.thiyagarajan09@gmail.com" target="_blank">priya.thiyagarajan09@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Respected sir,<br><br>i want to add metal ions Ni2+ and co2+  during my  simulation.<br><br>can anyone help me how to set parameters to define new ion Ni2+ and co2+  in gromacs forcefield..<br>
<br>i edited in ions.itp file and tried but i got error atomtype not found..<br></blockquote><div><br></div><div>You need to modify the .rtp file as well. Follow this:</div><div><a href="http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Adding_a_Residue_to_a_Force_Field">http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Adding_a_Residue_to_a_Force_Field</a></div>
<div><br></div><div>-Anirban</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>can anyone please explain me elaborately how to set parameters ..<br><br>please help me with your answer.. <br><br>Thanking you,<br><br>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br>