Hi,<br><br>if you want to calculate the potential of some groups (0, 3, 11), using make_ndx to creat a new group consisting of these groups. Then running g_potential.<br><br>Cuong<br><br><br><br><div class="gmail_quote">2012/5/16 Andrew DeYoung <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:adeyoung@andrew.cmu.edu" target="_blank">adeyoung@andrew.cmu.edu</a>&gt;</span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
I am using the utility g_potential.  It takes (among other files) an index<br>
file.  At the beginning of the run, it prompts me for a selection from the<br>
index file.  Is it possible to make more than one selection, such that the<br>
potential is calculated for each selection, _separately_?  If I enter<br>
something like this:<br>
<br>
0 3 11<br>
<br>
The output seems to only include the potential due to the first selection<br>
(&quot;0&quot;) and seems to ignore the others.<br>
<br>
Thanks for your time!<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Andrew DeYoung<br>
Carnegie Mellon University<br>
<br>
--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
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</font></span></blockquote></div><br><br clear="all"><br><br><div> </div><br>