Hi ,<br><br>You run extended simulation of 10 ns  on your first  10ns simulation .<br>You get <font face="Calibri"><span lang="EN-US"><font size="3">traj20ns.xtc.<br>these new trajectory contain all the tme frame from onwards 10ns.<br>
So if you are giving command <br><br></font></span></font><font face="Calibri"><p style="margin:0cm 0cm 10pt" class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><font size="3">trjconv –f traj20ns.xtc –s topol.tpr –b 10000 –e
10000 –o snapshot20ns.gro      (</font></span><span lang="EN-US"><font size="3">Note:
 traj20ns.xtc is not a full trajectory, it just a trajectory of second
10ns simulation)</font></span></p><p style="margin:0cm 0cm 10pt" class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><font size="3">with traj20ns.xtc if you need 20 ns snapshot use -b 20000 -e 20000</font></span></p><p style="margin:0cm 0cm 10pt" class="MsoNormal">
<br><span lang="EN-US"></span></p><p style="margin:0cm 0cm 10pt" class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><font size="3">With Best Wishes,</font></span></p><p style="margin:0cm 0cm 10pt" class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><font size="3">Rama David</font></span></p>
<p style="margin:0cm 0cm 10pt" class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><font size="3"><br></font></span></p></font><br>